يمكن تقسيم الإنزيمات إلى ستة مجاميع رئيسية اعتمادا على نوع التفاعلات التي تحفزها وهي:

1. إنزيمات الأكسدة والاختزال Oxidoreductane الذي تحفز نقل الإلكترونات.

 2. الإنزيمات الناقلة Transferases وهي الإنزيمات التي تحفز تفاعلات نقل مجموعة معينه.

3. إنزيمات التحلل المائي hydrolases وهي إنزيمات تحفز نقل مجاميع وظيفية إلى الماء.

 4. الإنزيمات النازعة Lyases وهي الإنزيمات التي تحفز إضافة مجاميع إلى الاصرة المزدوجة أو العكسية.

5. الإنزيمات المناظرة Isomerases وهي الإنزيمات الذي تنقل مجاميع داخل الجزيئات لانتاج أشكال متناظرة.

6. إنزيمات التخليق Ligases وهي الإنزيمات التي تحفز تكوين أواصر كربون- كربون، كربون – كبريت، كربون - أوكسجين، كربون – نتروجين، بواسطة تكثيف تلـك المركبات المتفاعلة.