يرجع لون ثمار الفلفل إلى خليط من صبغات الليكوبين lycopene، والزانثوفيل xanthophyll والكاروتين carotene، وتوجد صبغة الكاروتين منفردة في الأصناف الصفراء. وتعتبر صبغة الكابسانثين capsanthin من أهم الصبغات التي توجد في البابريكا. ولا تبدأ الصبغات الحمراء في الظهور إلا بعد وصول الثمار إلى طور النضج الأخضر، ويتأثر ظهورها بدرجة الحرارة السائدة؛ فتكون بصورة جيدة في مدى حرارى من 18 - 24° م سواء أكانت الثمار على النبات، أم في المخزن، ويكون اللون الأحمر مشوبا بالاصفرار إذا ارتفعت درجة حرارة الثمرة إلى أكثر من 27° م خلال معظم فترة التلوين، كما تقل سرعة ظهور اللون الأحمر مع انخفاض درجة الحرارة عن 18م ، إلى أن يتوقف التلوين تماما في درجة 13° م ؛ لذا .. نجد أن الأصناف التي تستهلك حمراء يكون تلوينها رديئا إذا كان نضجها متأخرا في الخريف. وليس لضوء الشمس أو الظلام أي تأثير على ظهور اللون الأحمر إلا من خلال تأثيرهما غير المباشر على درجة حرارة الثمار.