1- طبيعة غشاء الفرز من ناحية الفتحات التي تحويه

2- وقت تغيير المحلول : والذي يفضل غالباً كل أربع ساعات يتم تغيير المحلول المنظم وذلك لان عند تساوي التركيز للأملاح في الداخل والخارج سوف تقل عملية الفرز الغشائي.

3- عملية التحريك Stirring : إذ أن زيادة سرعة التحريك مع ملاحظة عدم التأثير على الغشاء تؤدي الى زيادة عملية الفرز.

4- الضغط: يمكن ان تتأثر عملية فصل المركبات ذات لأوزان الجزيئة الصغيرة عن المركبات ذات الأوزان الكبيرة بالضغط التدريجي على طرفي غشاء الفرز.

5 درجة الحرارة: ان معدل عملية الفرز للمركبات تزداد بازدياد درجة الحرارة بسبب انخفاض لزوجة المحلول المستخدم وزيادة الطاقة الحركية للجزيئات مما يؤدي الى زيادة معدل الانتشار عبر غشاء الفرز.

ومن الجدير بالذكر بأن الجزيئات الكبيرة كالبروتينات مثلاً تتأثر بارتفاع درجة الحرارة الحدوث عمليــة المسخ (Denaturation) فيفضل إجراء الفرز بدرجات حرارة واطئة.

إن من مساوئ هذه التقنية هي طول الفترة الزمنية المستغرقة للوصول الى حالة التخلص من المركبات ذات الأوزان الجزيئية الصغيرة مما تستبدل بطريقة الترشيح الهلامي كبديل عن هذه التقنية.