يمكن أن تخزن القرون بسهولة في الأكياس، أو على هيئة أكوام، ولكن يجب ألا تترك في العراء معرضة بشكل مباشر لأشعة الشمس، حيث يؤدي ذلك إلى تجفيف البذور بشكل زائد، مما يؤدي إلى تضررها. ويجب أن يتراوح محتوى القرون من الرطوبة بين 8–10% عند الرغبة في تخزينها لفترة زمنية قصيرة، في حين يؤدي انخفاض محتوى القرون المائي إلى ما دون ذلك إلى تشققها. وعند تخزين القرون التي ستستخدم بذورها لأغراض التربية Breeding، فيجب أن تكون المستودعات مهواة بشكل جيد للمحافظة على حيوية البذور لأكثر من موسم نمو. وعندما تكون درجة حرارة المخزن قرابة 2-4م، والرطوبة النسبية قرابة 6.5 % فيمكن تخزين البذور مدة عامين دون أن يحدث فقد كبير في حيويتها. وعند الرغبة في حفظ الأصول الوراثية القيمة فيجب ألا يزيد محتوى البذور المائي عن 5.5 %، وتخفض درجة حرارة المخزن إلى ما دون -18°م. ويمكن أن يترافق تخزين قرون الفول السوداني مع تشكل الأفلاتوكسينات Aflatoxins في الكسبة.