حلزونات ألفا α-helixes

تركيب ينتج من التواء السلسلة الببتيدية المفردة، والتوزيع الأساسي للحلزونات يشبه المفك الميكانيكي Cork Screw  ويختلف محتوى البروتينات من الحلزونات ، فالبعض منها يخلو من هذه التراكيب في حين يكون البعض الآخر مكون بشكل كلي من حلزونات ألفا . وحلزون ألفا تركيب شبه عصوي يمثل الجزء الداخلي منه السلسلة الرئيسة او العمود الفقري وتبرز السلاسل الجانبية الى الخارج كما موضح في الشكل : 

ويتم تثبيت الحلزون بالآصرة الهيدروجينية بين مجموعة الأمين ومجموعة الكربوكسيل للسلسلة الرئيسة وتترتب الأواصر الهيدروجينية بحيث تكون السلاسل الجانبية الى الخارج وبصورة عمودية على محور التوالي كما في الشكل : 

وتكون كل لفة في الحلزون مكونة من 3.6 حامض أميني والمسافة بين اللفات 5.4 انكستروم  واتجاه لوي الحلزون يمكن ان يكون الى اليمين باتجاه عقرب الساعة او الى اليسار بعكس اتجاه عقرب الساعة، ووفقا لمخطط راماجاندران الموضح في الشكل : 

ان كلا الاتجاهين ممكناً ولكن في البروتينات فان الأغلبية العظمى من الحلزونات تلتف الى اليمين لانها مفضلة ناحية الطاقة وذلك بتقليل التصادم بين مجاميع السلسلة الرئيسة والسلاسل الجانبية . ويكون معدل زاوية φ حوالي من º60 والزاوية ψ حوالي 45 . وتميل الثمالات الكارهة للماء ان تكون الى الداخل والمحبة للماء الى الخارج ، وبناءا على الحسابات أعلاه فان كل ثالث ثمالة في التوالي تميل ان تكون كارهة للماء، وتميل حلزونات ألفا الى احتواء كل من الالنين والكلوتامين والليوسين والمثيانونين ولكن ليس الكلايسين والبرولين او التايروسين. وبما ان الأواصر ألفاعلة بشكل رئيس في هذا المستوى من التركيب هي الأواصر الهيدروجينية لذلك تكون أكثر ثبوتا عند قلة الماء.