يبدأ تاريخ المدينة مع قدوم الفينيقيين ح 1200 ق.م. وانشاء اول مرفأ بحري على خليج الجزائر تملكها الرومان بعد سنة 146 ق.م. مع نهاية الحروب البونية، وأصبحت تسمى إكوسيوم توالت على المدينة فترات الوندال ثم البيزنطيين ثم مقدم العرب ح 650م حملت المدينة بعدها اسم جزائر بني مزغنة، للجزر الواقعة على خليجها وملازمة قبيلة بني مزغنة البربرية لجوارها.

أعاد بلكين بن زيري بناءها ح960م. عرفت المدينة فترات متعددة نداول عليه الزيريون، الحماديون، الموحدون، بنو عبد الواد كما عرفت هذه الفترات مقدم قبيلة الثعالبة والتي بسطت نفوذها على المدينة وما جاورها وكان من أبناءها عبد الرحمن الثعالبي 1387 – 1468م صاحب التفسير المشهور.

بعد سقوط مدن الاندلس تباعا بدأت المدينة تستقبل وفود الاندلسيين النازحين عام 1510م احتل الاسبان احدى الجزر الصخرية المحاذية للمدينة شكل الأهالي بعدها وفدا ثم أرسل إلى اسطنبول لمقابلة السلطان سليم العثماني وطلب العون. بدأ العهد التركي مع مقدم الاخوان بربروسة المدينة سنة 1516م أصبحت المدينة عاصمة البلاد التي دخلت تحت الوصاية العثمانية حاول الامبراطور شارل الخامس الاستيلاء على المدينة سنة 1514م لكن عاصفة دمرت قطع الاسطول الضخم الذي أعده عرفت المدينة كمعقل للقراصنة الذين شنوا حملات منظمة على الاساطيل المسيحية مما عرض المدينة لحملات قصف عديدة، فرنسة 1684، انكلترة وهولندا 1816م.

بعد حادثة المروحة 1828م تمكن الفرنسيون بقيادة المارشال بورمون من الاستيلاء على المدينة سنة 1830م أصبحت مقرا للحكام العسكريين الفرنسيين وكذا الادارة المدنية، نزلت بها قوات الحلفاء سنة 1942م كما انشأ فيها اللجنة الفرنسية للتحرير الوطني – كانت فرنسا محتلة من طرف النازيين – سنة 1943م والتي اصبحت منذ جوان 1944 م تعرف باسم الحكومة المؤقتة للجمهورية برئاسة الجنرال ديغول.

عرفت المدينة احداث حرب التحرير ما بين 1954 – 1962م كما جرت في شوارعها ما عرف بمعركة مدينة الجزائر 1957م حاول بعض الجنرالات الفرنسيين سنة 1961م الانقلاب على القيادة المركزية والاستقلال بالجزائر الا ان المحاولة فشلت ثم كان ان استقلت البلاد عام 1962م وأصبحت المدينة عاصمة رسمية للجمهورية.