لا نستطيع إنكار مزايا معامل جيني العديدة، ومنها اعتماده عالميًا وقابليته على الانتشار،لكنه ما يزال يعاني بعض السلبيات،مثل:1- تحيز العينة المدروسة: تعتمد دقة حسابات معامل جيني على حجم العينة المدروسة،فغالبًا ما يعطي معامل جيني قيمة منخفضة في البلدان الصغيرة أو البلدان ذات التنوع الاقتصادي القليل، في حين يسجل المعامل قيمة عالية في البلدان الكبيرة والمتنوعة اقتصاديًا.
2- عدم دقة البيانات. 3 ـ قيمة واحدة لمعامل جيني لكن بتوزيع مختلف الدخل. 4 ـ عدم الاكتراث للتغيرات الهيكلية في المجتمع.