من ناحية العمق نجد أن المحيط الهندي متجانس من ناحية أعماقه، حيث إن ٦٠ % منه يتكون من سهل عميق يتراوح عمقه بين ٢٠٠ و ٣٠٠ قامة, ويكاد المحيط الهندي يخلو من المنخفضات الطولية اللهم إلا في منطقة منخفض وسوندا حيث يصل العمق إلى ٤٠٧٦ قامة، ويوجد في المحيط الهندي بعض السلاسل الواسعة التي تفصل بين الأحواض العميقة، وتمتد إحدى هذه السلاسل بين الطرف الجنوبي لشبه جزيرة الهند وبين القارة القطبية الجنوبية. وهناك سلسلة عرضية تسمى سلسلة سقطرة – شاجوس Socorta – chagos وتمتد من رأس غردفوي Guardafui لتقابل السلسلة الطولية وسلسلة سيشل Sychelles وتقع موازية للسلسلة السابقة وإلى الجنوب منها بحوالي ٨٠٠٠ ميل (أنظر شكل رقم 1) .

وجزيرة سيلون Cylon وكذلك بعض الجزر الأخرى الصغيرة مثل جزيرة سقطرة Socotra بلقرب من رأس غردفوي أو قمة القرن الأفريقي، وجزيرة زنجبار Zangibar وجزيرة كومورو Comoro أما جزر أندامان Andaman وجزر نيكوبار Nicobar في خليج بنغال فهي تكون الأجزاء البارزة من امتداد الجزء الغارق من سلسلة جبال أركان يوما في بورما Arakan Yoma  , وهناك بعض الجزر المرجانية في المحيط الهندي وخاصة في جنوب غرب شبه جزيرة الهند وأهمها جزر لاكاديف Laccadives وجزر مالديف Maldives أما جزيرتا موريشيس Mauritis ورينيون Reunion فهما من أصل بركاني وتقعان إلى الشرق من جزيرة مدغشقر أما الجزء الشرقي من المحيط الهندي فيكاد يكون خاليا من الجزر، حيث إن قاع المحيط الهندي عميق في هذا الجزء منه ,ولا توجد في هذا الجزء سوى مجموعة جزر كوكس Cocos وجزيرة كريسماس Chridtmas .