المثبطات الإنزيمية هي تلك المواد الذي تخفض من سرعة التفاعلات الإنزيمية وذلك من خلال تأثيرها إما على المرافق الإنزيمي وapoenzyme والمجموعة الرابطة أو المنشطات الموجودة في النظام الإنزيمي أو التدخل مع ارتباط المادة الأساس مع الإنزيم ومن هذه المثبطات هي:

أ. المثبطات التي تعمل على بروتين الإنزيم: أملاح المعادن الثقيلة مثل الفضة، الزئبق، النحاس، الكادميوم والرصاص تعمل كمرسبات بروتينية بسبب أيونات ذات الشحنه الموجبة إلا انه بصورة عامة أن تراكيز أيونات الفضة اللازمة للتثبيط الكامل للإنزيم هي كميات اقل بكثير من المكونات اللازمة لترسيب البروتين، urease يكون غير فعال كليا ولا عكسيا بواسطة أربع ذرات من الفضة لكل جزيئة، حيث إنها تؤثر على بعض الأجزاء من الإنزيم المسؤولة عن النشاط، بعض الكواشف مثل ثلاثي كلور وحامض الخليك وفوسفو حامض التنكستيك تعمل كمواد مسربة للبروتينات بسبب وجود الشحنات السالبة عليها ، عوامل الأكسدة والدنترة والاستلة تعمل على المجاميع الحساسة مما تثبط نشاط الإنزيم، الإنزيمات الذي نشاطها يعتمد على السلفاهيدريل تصبح غير فعالة بواسطة النحاس والزئبق ويمكن إزالة تأثيرها المثبط بواسطة استخدام مواد متشابكة ها مثل اثيلين ثنائي أمين رباعي الخلات (EDTA) الذي يكون معقدات مع الأيونات المعدنية ، بعض المواد الكيمياوية مثل N-ethyl maleimide iodoacetamide تتفاعل لا عكسيا مع مجاميع السلفا هيدريل (الثايول) للإنزيمات، حيث يثبط iodoacetate التحلل المائي في العضلات كما يمكن أن تتفاعل مع المستدين وبعض الأحيان مع المثيونين، تتفاعل عكسيا para-chloromercuribenzoate مع مجاميع الثايول لتكوين mercaptides استعمالات organophosphorus مثل diisopropyl flour phosphate الذي مختصرها DEP الذي تسبب فسفرة أو إضافة أسيل إلى المجموعة الذي ترتبط مع المادة الأساس في الموقع الفعال مجموعة الهيدروكسيل للسيرين . endopeptidase, mutase

ب. المثبطات التي تحمل على المجموعة الرابطة prosthetic group الإنزيمات ذات النشاط الذي يعتمد على وجود معقد بورفيرين - حديد مثل cytochrome oxidase ويمكن تثبيطها بواسطة أول أو كسيد الكربون، السيانيد، الازايد، كبريتيد الهيدروجين ويعمل أول أو كسيد الكربون على تثبيط مدى واسع من الإنزيمات الحاوية حديد أو نحاس لأن مركبات أول أكسيد الكربون الإنزيمات البروتين اهيمي heme protein تتفكك بالضوء، فهي صفة مهمة للتعرف على إنزيم cytochrome oxidase كما يعمل السيانيد على تثبيط إنزيم cytochrome oxidase أيضا و xanthine oxidase ، وممكن أن يثبط نشاط الإنزيم في آليات مختلفة مثل الارتباط مع المعدن مما يعمل كعامل مختزل على الروابط ثنائية الكبريتيد أو بواسطة الارتباط مع المجاميع الالديهايدية الأساسية في المرافقات الإنزيمية أو بواسطة خفض التثبيط، العوامل المؤكسدة والمختزلة يمكن أن تثبط الإنزيمات بواسطة عملها على المجموعة الرابطة.

ج. المثبطات التي تعمل على المرافقات الإنزيية: يعتبر البيريدوكسال فوسفيت مرافق إنزيمي للإنزيم amino acid decarboxylase، فأن مجموعة الالديهايد تكون حساسة لعمل كاشف الكربونيل مثل hydroxylamine semi carbazide والسيانيد الذي يرتبط معها لتثبيط الإنزيم.

د. المثبطات التي تعمل على المنشطات الايونية : الفلوريد يثبط الإنزيمات المحفزة بواسطة المغنيسيوم مثل enolase والإنزيمات الأخرى مثل ATPase بواسطة ترسيب أيونات الكالسيوم الذي تكون أساسية للإنزيم مركب diethyl dithiocarbonate يثبط الإنزيمات الحاوية نحاس بواسطة ارتباطها مع المعدن، carbonic anhydrase يثبط بواسطة زيادة أيونات الزنك حتى ولو أن الزنك أساسي للجزيئة، zymohexase يثبط بواسطة العوامل الرابطة للمعدن مثل السستائين ألفا، ألفا - ثنائي بيريديل بيروفوسفيت ويستعيد الإنزيم نشاطه بواسطة أيون الحديدوز ، أيون الكوبالت وأيون الزنك والنحاسيك، myosin ATPase يثبط بواسطة أيون الزئبقيك والفضة لكن ينشط بواسطة أيون الكالسيوم والمنغنيز، . ، مادة Beryllium يثبط إنزيم الفوسفاتيز القلوي الذي يحتاج أيون المغنيسيوم كمنشط، سمية السيلينيوم تعزى إلى استبدال الكبريت

ه. المثبطات الذي تتداخل مع ربط المادة الأساس: يمكن خفض سرعة أكسدة السكسنيت بوجود إنزيم succinate dehydrogenase بواسطة المالونيت وتزداد مع إضافة السكسنيت، يتنافس المالونيت مع السكسنيت للارتباط في الموقع الفعال من الإنزيم وعندما يوجد المالونيت بتركيز مرتفع نسبيا يمكن أن يعيق التفاعل، الزيادة الكافية في كمية السكسنيت يمكن أن تستبدل المالونيت من الإنزيم.