تتأثر الكتل الحيوية المائية بتغيرات الـ pH الشديدة نتيجة لتغير الضغط الحلولي في خلاياها، ولا تستطيع العيش في وسط مختلف الملوحة هي معتادة عما عليه، فلا تستطيع أسماك البحار أن تعيش في المياه العذبة، كما أن أسماك المياه العذبة لا تعيش في البحار. وهناك مجال معين من قيمة pH الوسط تستطيع المتعضيات أن تعيش فيه.

يؤدي تلوث منابع المياه أحياناً إلى إنخفاض قيم الـ pH إلى أقل من 3، وتنتج الحموضة لهذه المياه عن النفايات الصناعية كتلبيس المعادن والأمطار الحامضية. وهي تشكل ظروفاً مميتة لمعظم الأحياء المائية، عدا بعض أنواع البكتريا.

بينما لا تنتج فرط القلوية المترافقة مع ارتفاع قيم pH الوسط المائي من فعاليات النشاط البشري بشكل مباشر، وإنما تنشأ بشكل أساسي من عناصر التربة، ويمكن للإنسان أن يساهم في تفاقم هذه المشكلة، بنقل هذه العناصر الطبيعية إلى المياه السطحية أو الجوفية كما في حفر الآبار، أو تغيير مجاري الأنهار.

تتزايد ملوحة المياه الطبيعية السطحية والجوفية خاصة أملاح الصوديوم والمغنيزيوم والكالسيوم حيث تظهر مشكلة الملوحة في فصل الصيف، وذلك عندما تتبخر كميات كبيرة من المياه تاركة وراءها أراض مرتفعة الملوحة غير صالحة لنمو النباتات، الأمر الذي يزيد من احتمال التصحر.