منهج البحث في علم الكلام أو الطريقة التي يعتمدها الباحث في دراسة مسائله وقضاياه، افكاره ونظرياته، يختلف باختلاف وجهات نظر علمائه ومدارسه التي تعرف بالفرق الكلامية في المنهج الذي ينبغي ان يتبع في دراسة وبحث الفكر الديني.

ويتلخص هذا في أن للمذاهب الاسلامية الكلامية خمسة مناهج معتمدة في البحث والدراسة، وهي:

1 - المنهج النقلي

2 - المنهج العقلي

3 - المنهج التكاملي

4 - المنهج الوجداني

5 - المنهج العرفاني

المنهج النقلي:

ويتمثل في الاعتماد على:

1 - اجماع الامة.

2 - اجماع الصحابة.

3 - سيرة الصحابة.

4 - اجماع السلف - وهم مسلمو القرن الاول الهجري - .

5 - الخبر المتواتر.

6 - خبر الواحد المتلقى بالقبول، وعند بعضهم، خبر الواحد مطلقاً.

7 - الأخذ بالنص الشرعي - قرآناً او حديثاً - بحمله على ظاهره الحقيقي من غير تأويل.

8 - عدم جواز الحمل على المجاز.

9 - التوقف في اعطاء الرأي :

أ - عند عدم وجود نص شرعي في المسألة.

ب - عند تعارض النصين الشرعيين وعدم وجود مرجح شرعي لاحدهما على الآخر.

ح - عند اجمال النص لانه متشابه أو لانغلاق فهم معناه أو لغيرهما.

وهو منهج أهل الحديث من الظاهرية والسلفية.

المنهج العقلي:

ويتمثل في الاعتماد على:

1 - الضرورة العقلية (بداهة العقول).

2 - سيرة العقلاء.

3 - البديهيات العقلية (المنطقية) وهي: استحالة الدور واستحالة التسلسل، واستحالة اجتماع وارتفاع النقيضين.

4 - المبادئ الفلسفية المسلم بها، مثل: مبدأ العلية، مبدأ القسمة الى الواجب والممكن والممتنع.

5 - اعتبار النصوص الشرعية مؤيدة ومؤكدة لمدركات العقل واحكامه.

6 - تأويل النصوص الشرعية التي تخالف بظاهرها مرئيات العقول وفق مقتضيات القرينة العقلية.

7 - الأخذ بالمتشابه بتأويله في ضوء ما ينهي اليه النظر العقلاني.

وهو منهج المعتزلة ومن تأثر بهم.

المنهج التكاملي:

ويتمثل في الاعتماد على:

1 - الجمع بين العقل والنقل لانه لا تعارض بينهما في الحقيقة والواقع.

2 - الأخذ بظاهر النص ان كان مجرداً من القرائن الصارفة، ولم يتعارض والضرورة العقلية، والا ففي ضوء ما يقترن به من قرائن نقلية أو عقلية، لفظية او معنوية.

3 - آيات القران يفسر بعضها بعضاً ويقرن بعضها البعض.

4 - السنة القطعية تقرن القران وتفسره.

5 - الأثر المنقول لا يعارض القرآن حتى ولو كان صحيحاً وفق قواعد علمي الرجال والحديث.

فإذا لم يمكن تأويله، تسقطه المعارضة من الاعتبار.

6 - جواز التأويل عند وجود ما يقتضيه.

7 - الحمل على المجاز مع وجود القرينة الداعية لذلك.

8 - تفسير المتشابه بالمحكم او تأويله في ضوء المعقولات المرعية. وهو منهج الامامية والاشاعرة ومن سار في هديهما.

المنهج الوجداني:

ويتمثل في اعتماده على سلوك الطرق المؤدية الى تصفية الباطن واستكمال الظاهر، بغية الفناء في الوصول الى مرحلة الحب الالهي.

وهو منهج الصوفية.

المنهج العرفاني:

وهو منهج تكاملي ايضاً يتمثل في الاعتماد على الجمع بين العقل والنقل والوجدان، فيأخذ من كلٍّ بطرف في حدود ما يتوصل به الى مستوى المعرفة المطلوبة.

وهو منهج الاسماعيلية. ونهجه ايضاً غير واحد من علماء الفرق الأخرى.