الجينوم الشامل Pan Genome

مجمع لكل الجينات في النوع اي انه يضم الجينوم المركزي مع الجينوم غير الضروري ويسمى ايضا Supra-Genome يحوي كل الجينات الموجودة في الانواع العائدة الى جنس واحد ، ويطبق في البكتريا والاركيا .

فهو يمثل مجمع لكل الجينات الموجودة في السلالات المختلفة الموجودة في الانواع فهو مجمع واتحاد للجينات . ومن هنا يتضح ان الاستمرار في تحديد تواليات سلالات مختلفة للنوع تساعد في اكتشاف جينات جديدة او عدم ظهور جينات كانت موجودة في سلالات سبق تحديد تواليها ، لذلك كان من الأفضل استعمال الجينوم الشامل لوصف النوع كما موضح في الشكل التالي لبعض البكتريا.

والملاحظ انه عند تحديد تواليات جينومات بعض الأحياء ان هناك زيادة في أعداد الجينات وهذه تدعى الجينوم الشامل المفتوح وتمثل حالة إضافة تواليات جديدة عند تحديد تواليات سلالات جديدة اي ان الإضافة ستكون للجينوم الشامل والمركزي. وتوجد في الأنواع التي تستعمر بيئات متعددة ومختلفة ولها طرق متعددة لتبادل المواد الوراثية ومنها على سبيل المثال لا الحصر المسبحيات الكروية Escherichia coli و Streptococci و Salmonella ، Helicobacter pylori ومكورات السحاية Meningococci في حين انه في بعض الأنواع المحددة مثل Bacillus anthracis لا تزداد الأعداد وانما توقفت عند عدد محدد بعد تحديد توالي 4 سلالات ومثل هذا يطلق عليه الجينوم الشامل المغلق، ويعد الجينوم مغلقا اذا كان ثبوته اقل من 20-35 %. وتوجد هذه في الأنواع التي تعيش في بيئات معزولة ولها قابليات محدودة لاستقبال الجينات من الخارج كما في بكتريا الجمرة الخبيثة المذكورة تواً وكذلك بكتريا السل Mycobacterium tuberculosis وChlamydia trachomatis ولعل أفضل الأمثلة عليها البكتريا Buchnera aphidicola التي تكون في حالة تعايشية مع المن Aphids وهذه لم يحصل تغيير او إعادة ترتيب لجينوماتها ولم تفقد او تكتسب مواد وراثية على مدى 50 مليون سنة الماضية كما تشير الدراسات الخاصة بها لذلك يعد جينومها من النوع الثابت بشكل كبير.
وتتبع الأحياء استراتيجيات مختلفة في توزيع جيناتها بين الجينوم المركزي والعام، فمثلا الجنس Streptomyces ذا المحتوى العالي من GC والمهم من عدة نواحي تمتلك خلاياه جينوما عاما يتراوح بين  8 - 10 ميكاقاعدة، ويمثل الجينوم المركزي 5- 6 ميكاقاعدة حاوية على الجينات الأساسية اما الباقي فهي الأطراف التي تعاني من تغييرات كبيرة، هذه المناطق تمتلك بحدود 510 جين لإنتاج مواد الايض الثانوي، كما ان بعض جينات الايض الثانوي تقع على البلازميدات البعض منها بلازميدات مفتوحة توجد في خلايا الجنس، وهذا التوزيع يعطى لأفراد الجنس مرونة واسعة كبيرة في إنتاج مواد مختلفة التي يمتاز بها الجنس.