أقرأ أيضاً
التاريخ: 13-12-2015
2221
التاريخ: 4-6-2018
1523
التاريخ: 29-4-2021
1960
التاريخ: 12-6-2018
1575
|
تقوس الدنا DNA Curvature
تراكيب منحنية من التواليات في جزيئات DNA تؤثر في مواصفات الجزيئات منها ارتباطها بالبروتينات والتضاعف والتأشب والتحول في ظفر الأشرطة وبدء الانتساخ وإنهاءه وتحديد مواقع الجسيمات النووية وترتيب الكروماتين ، ولذلك فأن التعرف على الصفات الميكانيكية تكون أساسية لفهم بايولوجية DNA لان العديد من الصفات الفسلجية – البايولوجية للDNA تتأثر بالتقوسات الموضعية ومرونة الجزيئة . ولذلك فأن الجينومات المختلفة لها تقوسات مختلفة في ممهداتها مما يشير الى تأثير الظروف البيئية في انتظام الجينوم وترتيبه والمناطق المقوسة من التواليات قد تكون أصيلة ولا تتأثر بالاجهادات وهي التي يطلق عليها التقوسات الذاتية Intrinsic Curvature وتكون بعيدة عن التقوسات التي تحثها حالات الإجهاد . وصفة تقوس DNA لها علاقة قوية بحركة قطع DNA في الهلام أثناء الترحيل الكهربائي ، فالقطع ذات التقوس العالي تتحرك ببطء على هلام Polyacrylamide Gel مقارنة بقطع الواسمات المستعملة ذات الوزن الجزيئي نفسه ، ولذا يعد الترحيل ولذلك كان للتقوس دورا" أساسيا" في تنظيم الجين ، وتوزيع مناطق التقوس في الممهدات يكون ثابتا" من الناحية التطورية وتحدد بشكل أساسي بحرارة البيئة . وتتوزع مناطق التقوس على جانبي المناطق المشفرة في الخلايا بدائية النواة ، والانحناءات الى اليمين في هذا النوع من الخلايا تكون في البكتريا المحبة للحرارة او المحبة لحرارة متوسطة متوفرة بشكل أكثر مقارنة بمناطق البدء )اليسار( مما يشير الى علاقة آليات التنظيم بين عمليات بدء وانتهاء الانتساخ وهذه تحدد بالظروف البيئية والعوامل الجينومية .والتقوس له علاقة بالمناطق الغنية بالنيوكلوتيدات الثنائية لذلك فأن التقوس في توالي معين يكون حاويا" على قطع من تواليات الأدنين Oligo (A) tracts ولكن التقوسات لا تحصل عند وجود الأدنين فقط ولذلك انصب الاهتمام على دراسة النيوكلوتيدات الثنائية والثلاثية باستعمال الأشعة السينية والرنين المغناطيسي النووي فضلا" عن استعمال الترحيل الكهربائي وحركيات التحلق Cyclization Kinetics وغيرها ، وطرق استعمال النيوكلوتيدات الثنائية تكون أسهل من استعمال النيوكلوتيدات الثلاثية عند حساب قيم مختلفة تتعلق بالظاهرة .
وقد وجد ان التقوس يمكن ان يحصل نتيجة للانتفال الحاصل عند تلاقي هيئات B' - DNA وهو التركيب غيرالطبيعي لقطع الأدنين مع B- DNA المعروف بأنه يملك تركيب متجانس وصلد للأشرطة الحلزونية المزدوجة ووجد ان له صفات تركيبية تلعب دورا" أساسيا" في العديد من العمليات الحيوية . وان التواليات A4 T4 CG )n) تظهر ترحيل كهربائي غير طبيعي في حين ان T4 A4 CG ) n) تكون طبيعية وهذه الصفات لا تتغير عند استبدال CGب GC . وفضلا" عن ذلك وجد ان A tracts ليس لها هيئات موحدة وانما تعتمد على التواليات المجاورة . وقد قيس تقوس A4 T4 CG وكان º 26 في حين T4 A4 CG تتقوس بدرجة 8 °. وهي متطابقة مع بيانات التحلق ، فالتوالي الأول وكما يلاحظ يتقوس بشدة في حين ان T4 A4 CG تبقى مستقيمة وكل هذا يؤثرفي تناظر الالتفاف الفائق للحلزونات .
وهناك بعض العوامل المؤثرة في توزيع المناطق المقوسة في المناطق بين الجينات ومنها
- درجة حرارة النمو
- مكونات الجينوم من AT
- حجم الجينوم
- وجود الماء الذي يؤثر بشكل كبير في تقوسات DNA .
لذلك فالملاحظ ان تقوس DNA يختلف بارتفاع درجة الحرارة ، ويمكن ان تتغير فعاليات هذه المناطق بشكل يعتمد على انخفاض الحرارة .
تشارك مناطق التقوس في عدد من الوظائف والتي تعتمد على مواقعها ، فضلا" عن ان وظائفها فقد تكون مباشرة او غير مباشرة بواسطة التلامس مع البروتينات المنظمة او الإنزيمات ، ففي هذا المجال فأن التقوسات يمكن ان تعمل كمواقع لارتباط بعض البروتينات التي تساعد في إنهاء الانتساخ سواء تلك المناطق المعتمدة علىρ) rho ) المستعملة عنه كما في بكتريا Bacillus subtilis و Escherichia coli.
ومن الآليات الأخرى التي تساهم التقوسات فيها تشجيع الانتساخ بآليات مختلفة مثل تشجيع ارتباط إنزيم RNA Polymerase، او زيادة ألفة معقدات الانتساخ بتكوين عروة كبيرة حول الانزيم وبالتالي جلب مكونات الانتساخ الواقعة على مسافات بعيدة وغير متاحة للتجمع مع بعضها ، وهذا يشير الى ان تقوس DNA له ادوار مختلفة في تنظيم الجين ، فضلا" عن عمله كإشارات للتعرف على البروتينات المنظمة . وتعد المرونة والتقوس في DNA احد ضروريات تداخل DNA مع البروتينات ،واحد مظاهرها التأثير في الفعالية الحيوية والتي تعود الى الصفات التركيبية والميكانيكية لل DNA وهو تكوين العروات لل DNA التي تتوسطها البروتينات . والتقوس يقلل من كلفة الطاقة خاصة للعروات الثابتة والأخرى اللازمة لتغيير طبوغرافية العروات . والعديد من البروتينات التي ترتبط الى DNA تؤدي الى ثنيه اذ ان البروتينات يمكن ان تميز أهدافا" مقوسة في التواليات وتؤدي الى تغيير تقوسها كما هو الحال في بعض الأدوية. وتداخل البروتينات مع DNA له علاقة بتقوس جزيئة DNA سواء عند ارتباط عوامل الانتساخ كما موضح في الشكل التالي ، او تكوين الجسيمات النووية كما موضح في الشكل
|
|
مخاطر خفية لمكون شائع في مشروبات الطاقة والمكملات الغذائية
|
|
|
|
|
"آبل" تشغّل نظامها الجديد للذكاء الاصطناعي على أجهزتها
|
|
|
|
|
الزائرون يحيون ليلة الجمعة الأخيرة من شهر ربيع الآخر عند مرقد أبي الفضل العبّاس (عليه السلام)
|
|
|