أثرت عن الإمام أمير المؤمنين كوكبة من الأدعية في الاستغفار والإنابة إلى الله تعالى كان منها ما يلي :

اللهمّ إنّي أستغفرك من كلّ ذنب قوي عليه بدني بعافيتك أو نالته قدرتي بفضل نعمتك أو بسطت إليه يدي بسابغ رزقك أو اتّكلت فيه عند خوفي منه على أناتك أو احتجبت فيه من النّاس بسترك أو وثقت من سطوتك عليّ فيه بحلمك أو عوّلت فيه على كرم عفوك , اللهمّ إنّي أستغفرك من كلّ ذنب خنت فيه أمانتي أو نحّست بفعله نفسي أو احتطبت به على بدني أو قدّمت فيه لذّتي أو آثرت فيه شهوتي أو سعيت فيه لغيري أو استغويت إليه من تبعني أو كايدت فيه من منعني أو قهرت عليه من عاداني أو غلبت عليه بفضل حيلتي أو أحلت عليك مولاي فلم تغلبني على فعلي إذ كنت كارها لمعصيتي فحلمت عنّي لكن سبق علمك فيّ بفعلي ذلك لم تدخلني يا ربّ فيه جبرا ولم تحملني عليه قهرا ولم تظلمني فيه شيئا فأستغفرك له ولجميع ذنوبي , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب تبت إليك منه وأقدمت على فعله فاستحييت منك وأنا عليه ورهبتك وأنا فيه تعاطيته وعدت إليه , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب كتبته عليّ بسبب خير أردت به وجهك فخالطني فيه سواك وشارك فعلي ما لا يخلص لك أو وجب عليّ ما أردت به سواك وكثير من فعلي ما يكون كذلك , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب تورّك عليّ بسبب عهد عاهدتك عليه أو عقد عقدته لك أو ذمّة واثقت بها من أجلك لأحد من خلقك ثمّ نقضت ذلك من غير ضرورة لزمتني فيه بل استزلّني إليه عن الوفاء به الأشر ومنعني عن رعايته البطر , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب رهبت فيه من عبادك وخفت فيه غيرك واستحييت فيه من خلقك ثمّ أفضيت به فعلي إليك , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب أقدمت عليه وأنا مستيقن أنّك تعاقب على ارتكابه فارتكبته , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب قدّمت فيه شهوتي على طاعتك وآثرت محبّتي على أمرك وأرضيت فيه نفسي بسخطك وقد نهيتني عنه بنهيك وتقدّمت إليّ فيه بإعذارك واحتججت عليّ فيه بوعيدك , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب علمته من نفسي أو ذهلته أو نسيته أو تعمّدته أو أخطأته ممّا لا أشكّ أنّك سائلي عنه وأنّ نفسي مرتهنة به لديك وإن كنت قد نسيته أو غفلت نفسي عنه ؛ اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب واجهتك به وقد أيقنت أنّك تراني وأغفلت أن أتوب إليك منه أو نسيت أن أتوب إليك منه أو نسيت أن أستغفرك له , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب دخلت فيه وأحسنت ظنّي بك أن لا تعذّبني عليه وأنّك تكفيني منه , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب استوجبت به منك ردّ الدّعاء وحرمان الإجابة وخيبة الطّمع وانفساخ الرّجاء , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب يعقّب الحسرة ويورث النّدامة ويحبس الرّزق ويردّ الدّعاء , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب يورث الأسقام ويعقّب الضّناء ويوجب النّقم ويكون آخره حسرة وندامة , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب مدحته بلساني أو هشّت إليه نفسي أو اكتسبته بيدي وهو عندك قبيح تعاقب على مثله وتمقت من عمله , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب خلوت به في ليل أو نهار حيث لا يراني أحد من خلقك فملت فيه من تركه بخوفك إلى ارتكابه بحسن الظّنّ بك فسوّلت لي نفسي الإقدام عليه فواقعته وأنا عارف بمعصيتي لك فيه , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب استقللته أو استصغرته أو استعظمته وتورّطت فيه , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب مالأت فيه على أحد من بريّتك أو زيّنته لنفسي أو أومأت به إلى غيري ودللت عليه سواي أو أصررت عليه بعمدي أو أقمت عليه بحيلتي , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب استعنت عليه بحيلتي بشيء ممّا يراد به وجهك أو يستظهر بمثله على طاعتك أو يتقرّب بمثله إليك وواريت عن النّاس ولبّست فيه كأنّي اريدك بحيلتي والمراد به معصيتك والهوى فيه متصرّف على غير طاعتك , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب كتبته عليّ بسبب عجب كان بنفسي أو رياء أو سمعة أو خيلاء أو فرح أو مرح أو أشر أو بطر أو حقد أو حميّة أو غضب أو رضى أو شحّ أو بخل أو ظلم أو خيانة أو سرقة أو كذب أو لهو أو لعب أو نوع من أنواع ما يكتسب بمثله الذّنوب ويكون باجتراحه العطب , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب سبق في علمك أنّي فاعله فدخلت فيه بشهوتي واجترحته بإرادتي وقارفته بمحبّتي ولذّتي ومشيّتي وشئته إذ شئت أن أشاءه وأردته إذ أردت أن اريده فعملته إذ كان في قديم تقديرك ونافذ علمك أنّي فاعله لم تدخلني فيه جبرا ولم تحملني عليه قهرا ولم تظلمني فيه شيئا فأستغفرك له ولكلّ ذنب جرى به علمك عليّ وفيّ إلى آخر عمري , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب مال بسخطي فيه عن رضاك ومالت نفسي إلى رضاك فسخطته أو رهبت فيه سواك أو عاديت فيه أولياءك أو واليت فيه أعداءك أو اخترتهم على أصفيائك أو خذلت فيه أحبّاءك أو قصّرت فيه عن رضاك يا خير الغافرين , اللهمّ إنّي أستغفرك لكلّ ذنب تبت إليك منه ثمّ عدت فيه وأستغفرك لما أعطيتك من نفسي ثمّ لم أف به وأستغفرك للنّعمة الّتي أنعمت بها عليّ فقويت بها على معصيتك وأستغفرك لكلّ خير أردت به وجهك فخالطني ما ليس لك وأستغفرك لما دعاني إليه الرّخص فيما اشتبه عليّ ممّا هو عندك حرام وأستغفرك للذّنوب الّتي لا يعلمها غيرك ولا يطّلع عليها سواك ولا يحتملها إلاّ حلمك ولا يسعها إلاّ عفوك وأستغفرك وأتوب إليك من مظالم كثيرة لعبادك قبلي يا ربّ فلم أستطع ردّها عليهم وتحليلها منهم أو شهدوا فاستحييت من استحلالهم والطّلب إليهم وإعلامهم ذلك وأنت القادر على أن تستوهبني منهم وترضيهم عنّي كيف شئت وبما شئت يا أرحم الرّاحمين وأحكم الحاكمين وخير الغافرين , اللهمّ إنّ استغفاري إيّاك مع الإصرار لؤم وتركي الاستغفار مع معرفتي بسعة جودك ورحمتك عجز فكم تتحبّب إليّ يا ربّ وأنت الغنيّ عنّي وكم أتبغّض إليك وأنا الفقير إليك وإلى رحمتك فيا من وعد فوفى وأوعد فعفا اغفر لي خطاياي واعف وارحم وأنت خير الرّاحمين .

وهذا الدعاء صفحة مشرقة من أدعية إمام المتّقين وسيّد العارفين الذي وهب حياته لله تعالى.