وهي تسلسلات تنظيمية لعملية الاستنساخ ( Transcription regulatory sequences)، والتي قد تبتعد بآلاف النيوكليوتيدات باتجاه خارج اليسار أو اليمين من أساس الجين، أو حتى تقع ضمن أساس الجين، وتعمل في أي اتجاه، أي 5'  →       3'    او  3'    →    5'

وقد تعمل هذه التسلسلات على تنشيط الاستنساخ أكثر من المعدل الأساسي، لذلك تُدعى عناصر التشجيع (Enhancer elements)، أو تثبيط الاستنساخ بأقل من المعدل الأساسي، ولذلك تُدعى عند ذلك بعناصر الخمد (Silencer elements). من الأمثلة على ذلك، عناصر الاستجابة الهرمونية (Hormone-response elements) للهرمونات الستيرويدية والثايرويدية وفيتامين D وفيتامين A ومؤثرات أخرى. إن البروتينات المنشطة (المشجّعة) أو المثبطة التي ترتبط مع تلك العناصر تدعى بعوامل الاستنساخ (transcription factors) وتتداخل مع إنزيم الـ RNA polymerase بشكل مباشر أو غير مباشر من خلال بروتينات منشطة مرافقة أو مثبطة مرافقة ( Coactivator or corepressor proteins) لزيادة أو تقليل معدل الاستنساخ. تحتوي الجينات في العادة على عدد من العناصر المنظمة، ولكن بعض الجينات لا تمتلك ذلك، خصوصاً وأن الجينات المستنسخة التكوينية تمتلك معدل ثابت من الاستنساخ الأساسي .