وهي الاصرة التي تنشأ بين جزيئتين لمادة واحدة أو بين جزيئتين مختلفتين وتكون اكثر شيوعا في الكحولات، الفينولات، الاميدات، البروتينات، البيتيدات المتعددة والمواد اللاعضوية.

وخلال هذا النوع من التأصر الهيدروجيني توجد انظمة متعددة فعندما تتداخل جزيئتان أو اكثر متشابهتان فالاصرة الهيدروجينية الناتجة تسمى بالاصرة الهيدروجينية البينية المتجانسة (homo-Inter molecular hydrogen bonds) كما في الكحولات والحوامض الكربوكسيلية والاميدات. وان هذا النوع من التأصر الهيدروجيني المتجانس يمكن ان يحصل للمادة نفسها بحالتها الايونية وغير الايونية وهذه الاصرة تكون قوية ومثال ذلك الفينول في حالته الايونية وغير الايونية وكما موضح:⁽⁴⁷⁾

وفي حالة حصول التداخل بين جزيئتين مختلفتين فان الاصرة الهيدروجينية الناتجة تسمى بالاصرة الهيدروجينية البينية غير المتجانسة (Hetero-intermolecular) مثال على ذلك:

(R-OH . . . NR₃)

----------------------------------------------------------------

1. G.C. Pimental and MeCellellaw, (1960), “The Hydrogen Bond”, Freeman W.H. San Francisco, pp. 169-195.