تعبر قيمة الثابتة  pka عن قوة الأحماض الضعيفة

يعبر عن قوة الأحماض الضعيفة بواسطة ثابتة التفارق الحمضية Ka أو القيمة السالبة للوغاريتم هذه الثابتة  (pKa)  الخاصة  بكل حمض :

pKa = - log Ka

ويبين الجدول 4-1 قيم pK المجموعات الحمضية الضعيفة التي تحملها الأحماض الأمينية العشرون التي تدخل في بنية البروتينات ، وللتسهيل فقد استخدمت اللاحقة التحتية (a) ولكنها ستهمل لاحقا.

يبين الشكل أدناه الاشكال البروتونية لمجموعة الإيميدازول الموجودة في الهيستيدين ولمجموعة الجوانيدينو الموجودة في الأرجينين اللتين تكونان على شكل هجائن رنينية (متأرجحة) (Resonance hybrids) ويمكن ، بالتالي، تمثيلهما كما هو موضح على يمين الشكل مع توزيع الشحنة الموجبة بين ذرتي النتروجين (الهيستيدين) أو الذرات النتروجينية الثلاث (الارجينين).

تتعلق الشحنة الإجمالية للحمض الأميني (المجموع الجبري لكل الزمر ذات الشحنات السلبية والإيجابية الموجودة فيه)  بدرجة باهاء (pH) الوسط المحيط أو بتركيز البروتونات فيه ، وتسهل هذه الخاصية إمكانية تغيير شحنة الحمض الاميني بتغيير درجة الباهاء (pH) عملية الفصل الفيزيائي للأحماض الأمينية والببتيدات والبروتينات.